Chunin,  dosł. ninja średniej klasy, to shinobi, którzy osiągneli wyższy poziom niż Geninowie, a niższy niż Joninowie. Od ninja tej rangi wymaga się odpowiedzialności, znakomitego opanowania wszystkich podstawowych technik, doświadczenia bojowego i umiejętności działania w zespole. Niektórzy z nich, jak Iruka Umino, są nauczycielami, a inni, jak Shikamaru Nara, dowodzą małymi grupami podejmując ważne decyzje strategiczne i efektywnie wykorzystując zdolności podopiecznych im ninja. Shinobi klasy Chunin wysyłani są zwykle na misje klasy B, bądź C.

Aby zostać Chuninem Genin, razem ze swoją drużyną, bierze udział w wielkim egzaminie, znanym jako egzamin na Chunina. Egzamin ten składa się z trzech etapów: pierwszy etap ma za zadanie przetestować umiejętność gromadzenia informacji oraz zdolność podejmowania decyzji (jak również pojmowanie filozofii ninja), drugi etap sprawdza umiejętność wykonywania misji na podstawie wytycznych, trzecim etapem są walki pomiędzy shinobi, którym udało się przejść poprzednie dwa etapy, oglądane przez komisję, której zadaniem jest zdecydować kto zostanie Chuninem, a kto nie. Rezultat walki nie ma wpływu na decyzję komisji, na przykład Shikamaru Nara rezygnuje z walki w finale, a jednak awansuje do rangi Chunina z uwagi na umiejętności taktyczne - wiedział, iż ma zbyt mało czakry by kontynuować walkę. W ten sposób każdy, kto dostanie się do trzeciego etapu, ma szansę zostać Chuninem. Komisja może też uznać, iż żaden z zawodników nie posiada wystarczających kwalifikacji by zostać Chuninem. Jeśli zbyt wielu shinobi ukończy dwa pierwsze etapy etap trzeci może zostać wstrzymany. Na przykład podczas jednego z egzaminów do finału doszło aż siedem drużyn, niezwykle duża liczba jak na egzaminy, i przeprowadzone zostały eliminacje do trzeciego etapu. Przegrani nie brali udziału w kolejnym etapie i tym samym nie mogli ubiegać się o awans do rangi Chunina.

W przeszłości każda osada przeprowadzała własny egzamin, jednak po trzeciej wojnie ninja sprzymierzone osady zgodziły się na wspólne egzaminy w wybranej do tego wiosce. Miało to na celu polepszenie stosunków między osadami, a także uniknięcie przyszłych walk. Inną korzyścią wynikającą ze wspólnych egzaminów jest możliwość pozyskania potencjalnych klientów zainteresowanych wynajmem ninja. Z uwagi na wzrastającą liczbę ninja w każdej osadzie egzaminy przeprowadzane są dwa razy do roku.